Asociaciones del microbioma de la rizosfera con la diversidad del cultivos y las condiciones ambientales_
PT4. Líder: Dr. Tancredi Caruso (UCD).
Líderes de tareas: UCD, Univ. Silesia.
Socios involucrados: CSIC, Univ. Helsinki, Univ. Cukurova, CREA, Univ. Silesia, UCD
- Secuenciación de amplicones de las comunidades bacterianas y fúngicas de las rizosfera.
- Transcriptómica de la rizosfera de cebada.
- Integración de datos y modelización.
RecoBar explorará las relaciones entre la diversidad de los genotipos de cebada y el microbioma de la rizosfera, tanto hongos (incluyendo hongos micorrízicos arbusculares-AMF) como bacterias y profundizará en el conocimiento de las interacciones cebada-microbiota en diferentes condiciones ambientales.
La diversidad del cultivo será estudiada en seis genotipos representativos (micro-core) de la mejora vegetal en cebada a lo largo de la historia (dos variedades locales, dos cultivares antiguos y dos elite seleccionados en el PT1 procedentes de la colección reducida de muestras (mini-core)) crecidos bajo diferentes condiciones ambientales (en los PT1 y PT2) los cuales serán analizados mediante metagenómica y metatranscriptómica.
